目的对细菌耐药性监测在临床微生物检验中的应用价值进行分析探讨。方法将2015-2016年在本院主要科室送检的微生物标本筛选出4000例作为研究对象。其中标本的主要来源为:ICU的标本(500例),外科的标本(1000例),内科的标本(1300例),儿科的标本(1200例),对全部的标本都进行了细菌耐药性的相关检验,将各科室送检的微生物检验标本中的耐药菌株构成的情况进行对比,并对细菌耐药性监测应用在临床微生物检验中的效果进行分析探讨。结果ICU的标本中耐药的菌株为100例,占20.00%,外科标本中的耐药菌株为200例,占20.00%,在内科标本中耐药的菌株为150例,占11.54%,儿科标本中耐药的菌株为100例,占8.33%,经比较,ICU和外科送检的标本的耐药菌株检出率显著的比儿科和内科的要高,有显著的统计学意义(P<0.05),并且儿科和内科耐药菌株检出率进行比较,无显著的统计学意义(P>0.05)。结论在医院中的临床微生物检验中耐药菌株的检出阳性率是很高的,在实际的临床中我们要加强对抗菌药应用的规范性与安全性的管理,对细菌的耐药性监测要引起足够的重视,预防耐药菌株的发展和蔓延。