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以对大豆猝死病抗性不同的大豆品系U01-390489×E07080所衍生的F4：5代96个家系的C2连锁群上50个多态性SNP标记位点为基础数据，对比分析了利用Joinmap4．0及Icimapping2个软件不同计算方法所构建的遗传图谱的异同及优劣．结果表明，Icimapping构建的图谱长度较Joinmap4．0所建图谱短，Ieimapping包含的几种算法构建的图谱长度相近，Joinmap中Regression的计算方法所构建的遗传图谱与soybase上的一致图谱长度最为接近，Maximu