【摘 要】
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本研究旨在鉴定猕猴桃WRKY基因家族成员,为进一步研究AcWRKY转录因子在猕猴桃生长和发育进程及生物和非生物胁迫中的调控作用提供信息.利用‘红阳’猕猴桃全基因组数据,通过
【机 构】
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西南林业大学西南山地森林保育与利用省部共建教育部重点实验室,昆明,650224;北方民族大学生物科学与工程学院,银川,750021
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本研究旨在鉴定猕猴桃WRKY基因家族成员,为进一步研究AcWRKY转录因子在猕猴桃生长和发育进程及生物和非生物胁迫中的调控作用提供信息.利用‘红阳’猕猴桃全基因组数据,通过生物信息学在线分析网站与软件利用的方法,对猕猴桃WRKY转录因子家族成员进行鉴定和系统分析.分析表明:从猕猴桃全基因组中共鉴定出89个AcWRKY基因,分组鉴定和进化分析显示,AcWRKY蛋白可分为Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ个类型.Ⅰ组共有19个成员,其锌指结构是CX4CX22-23HXH (C2H2类型);Ⅱ组共有61个成员,进一步分为Ⅱa、Ⅱb、Ⅱc、Ⅱd和Ⅱe共5个亚组,分别有4、7、27、1 1和12个成员,其锌指结构为CX4-5CX23HXH(C2H2类型);Ⅲ组有9个成员,其锌指结为CX7CX23-24HXC (C2HC类型);AcWRKY蛋白序列比对及保守基序分析表明,AcWRKY结构域高度保守,但也存在一定的变异.染色体定位表明AcWRKY基因不均匀分布于除9号染色体外的28条染色体上,有1 1个WRKY基因无法定位到染色体上,同时发现部分基因存在串联复制现象.同源拟南芥不同组织的基因表达模式分析表明,33个WRKY基因在植物根、叶、花和果四个器官中均有显著性表达,但相对表达水平存在差异.猕猴桃WRKY基因家族具有丰富的生物学功能,与其它已报道的物种WRKY基因相似,广泛参与植物营养和生殖生长以及环境胁迫等多方面的调控.
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