【摘 要】
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目的 探讨膀胱癌发病的关键基因以及发病机制通路。方法 通过GEO数据库搜索膀胱癌基因芯片测序结果，计算机R语言（limma数据包）对测序原始数据进行均一化处理，GEO2R检测差异基因，通过芯片融合分析锁定共同发病基因。使用最新版本生物信息学分析对膀胱癌测序结果进行数据挖掘，包括DAVID基因转换、基因本体分析、KEGG信号通路分析，STRING蛋白互作分析，Cytoscape可视化处理，cytoh
【机 构】
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新疆医科大学第一附属医院泌尿外科新疆泌尿男生殖系统临床医学研究中心
【基金项目】
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新疆维吾尔自治区自然科学基金（2020DO1C261）；
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目的 探讨膀胱癌发病的关键基因以及发病机制通路。方法 通过GEO数据库搜索膀胱癌基因芯片测序结果，计算机R语言（limma数据包）对测序原始数据进行均一化处理，GEO2R检测差异基因，通过芯片融合分析锁定共同发病基因。使用最新版本生物信息学分析对膀胱癌测序结果进行数据挖掘，包括DAVID基因转换、基因本体分析、KEGG信号通路分析，STRING蛋白互作分析，Cytoscape可视化处理，cytohubba筛选膀胱癌关键基因。结果GSE61615包含2例膀胱癌组织和2例癌旁正常组织，GSE100926包含3例膀胱癌组织和3例癌旁正常组织。DAVID基因转换GSE61615共得到248个差异上调表达基因和628个差异下调表达基因。GSE100926共得到1109个差异上调表达基因和1862个差异下调表达基因。融合基因芯片分析显示109个共同差异上调和408共同差异下调基因。计算机R语言对差异表达数据进行校正后显示数据离散度较小。KEGG信号通路显示补体与凝血级联通路的富集程度最高。cytohubba计算前10位膀胱癌发病相关基因为IL-6、PTPRC、FCGR3A、CD8A、CSF1R、ITGAX、C1QA、LCP2、FGF2、FCGR2A，其中IL-6评分最高为72分。结论 高通量生物信息学分析提示IL-6为膀胱癌发病的最相关基因，补体与凝血级联通路为关键信号通路。
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