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【目的】为了分析日本和牛Y染色体USP9Y基因遗传多态性与父系起源。【方法】利用PCR扩增与限制性酶酶切方法。【结果】对8头日本和牛纯种及19头和秦F1代杂种牛进行Y染色体USP9Y基因多态性及父系起源研究，结果表明：日本和牛与其杂种牛都具有USP9Y基因多态性，USP9Y基因的PCR产物均显示471bp和552bp两种带型，其中552bp带型不能被SspI酶酶切，则这2种带型对应Y1和Y2两种普通牛单倍型组，表明日本和牛含有Y1和Y2两个父系支系，有2个普通牛父系起源。日本和牛和杂种牛单倍型多样度分别为