【摘 要】
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目的:基于网络药理学探讨竹节参防治肝癌的作用机制.方法:利用TCMSP、Swiss Target Prediction数据库结合文本挖掘方式,提取竹节参的化合物成分、化合物靶点关系,利用OMIM和Gene Cards网站提取竹节参的疾病靶点,R语言V4.0.3绘制Venny图以获得交集靶点,相关信息导入Cytoscape V3.8.2以获得化合物-靶点-疾病网络;依据交集靶点,在STRING网站获得蛋白互作网络,R语言V4.0.3进行GO、KEGG富集分析.结果:在TCMSP、Swiss Target P
【机 构】
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湖北民族大学,湖北恩施445000
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目的:基于网络药理学探讨竹节参防治肝癌的作用机制.方法:利用TCMSP、Swiss Target Prediction数据库结合文本挖掘方式,提取竹节参的化合物成分、化合物靶点关系,利用OMIM和Gene Cards网站提取竹节参的疾病靶点,R语言V4.0.3绘制Venny图以获得交集靶点,相关信息导入Cytoscape V3.8.2以获得化合物-靶点-疾病网络;依据交集靶点,在STRING网站获得蛋白互作网络,R语言V4.0.3进行GO、KEGG富集分析.结果:在TCMSP、Swiss Target Prediction库中共获得15种有效化合物,包括皂苷、多糖、黄酮类等,对应靶点数259个,药物与疾病交集靶点57个,导入STRING网站发现连线较多的靶蛋白为AKT1、VEGFA、CASP3等,药物-有效化合物-靶点-疾病网络图表明,度值较高的化合物是竹节参皂苷Ⅳa、竹节参皂苷Ⅳa_qt、人参皂苷Rg2_qt等;GO生物学过程富集分析发现:竹节参的关键靶蛋白主要通过调控内肽酶、蛋白丝氨酸/苏氨酸激酶、DNA结合转录激活活性RNA聚合酶Ⅱ特异性等方式起到改善肝癌的作用;KEGG富集通路发现竹节参影响肝癌主要通过PI3K-AKT、卡波西肉瘤相关疱疹病毒感染、脂质和动脉粥样硬化等信号通路.结论:竹节参防治肝癌具有多靶点、多通路的特点,其治疗机制可能是通过调控AKT1、VEGFA、CASP3的活性有关.
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