【摘 要】
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目的 分析子宫内膜异位症(endometriosis,EM)患者生物信息,探索异位内膜(ectopic endo-metrium,EC)组织中异常表达基因.方法 获取EM患者组织测序数据,筛选差异表达基因(diffe
【机 构】
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安阳市妇幼保健院检验科 河南省安阳市, 455000
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目的 分析子宫内膜异位症(endometriosis,EM)患者生物信息,探索异位内膜(ectopic endo-metrium,EC)组织中异常表达基因.方法 获取EM患者组织测序数据,筛选差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),使用DAVID工具进行DEGs基因注释,使用STRING在线分析DEGs编码蛋白间相互作用(protein protein interaction,PPI),确定候选基因.招募30名EM患者采集EC组织与在位内膜(EU)组织,验证候选基因表达.结果 筛选出826个DEGs,低表达665个,高表达161个.PPI分析确定13个候选基因.实时荧光定量PCR(real-time fluorescent quantitative PCR,qRT-PCR)验证,实验组HOXC4、HOXC6表达显著低于对照组(P<0.01),实验组HOXA5、HOXB7显著高于对照组(P<0.01).结论 HOX基因可能直接参与EM进展,检测HOX基因有望为揭示EM生物学机制提供依据.
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