【摘 要】
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提出了一种分子表面三角形面元分割的改进方法，并将该方法与边界元方法结合，用ＭＡＣＢＥＭ程序库计算了点电荷球模型的静电势、有机小分子的水化自由能以及蛋白质分子定点突变引起的活性中
【机 构】
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中国科学技术大学基础物理中心,中国科学技术大学生命科学学院
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提出了一种分子表面三角形面元分割的改进方法，并将该方法与边界元方法结合，用ＭＡＣＢＥＭ程序库计算了点电荷球模型的静电势、有机小分子的水化自由能以及蛋白质分子定点突变引起的活性中心基团ｐＫａ值的变化，得到与解析解或实验值一致的结果，从而验证了该方法和ＭＡＣＢＥＭ程序库的可靠性。
An improved method of binning the surface triangles of molecules is proposed. Combining this method with the boundary element method, the electrostatic potential of the point charge sphere model, the hydration free energy of small organic molecules and the fixed point of protein molecules are calculated by MACBEM program. Mutation caused by changes in the active center group pKa values, and analytic solution or experimental results consistent with the results to verify the reliability of the method and MACBEM library.
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