结直肠癌中O-型糖基化相关差异基因的筛选及分析

来源 :首都医科大学学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：z19910620

【摘要】

：

目的通过鉴定得出正常和异常O-型糖基化结肠癌细胞之间的差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),即O-型糖基化相关差异基因,并探讨其促进肿瘤发生发展的潜在机

【作者】

：

姚健楠高天博段凌刘健蒋玉良安广宇葛洋

【机构】

：

首都医科大学附属北京朝阳医院肿瘤科,首都医科大学附属北京朝阳医院医学研究中心

【出处】

：

首都医科大学学报

【发表日期】

：

2020年3期

【关键词】

：

结直肠癌 O-型糖基化基因表达谱差异表达基因 Cosmc 生物信息学 colorectal cancerO-glycosylationgene expres

【基金项目】

：

国家自然科学基金(81802738),北京市自然科学基金(7202051),北京市属医院科研培育计划(PX2020016),北京市附属医院科研培养计划(PX2017017)

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目的通过鉴定得出正常和异常O-型糖基化结肠癌细胞之间的差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),即O-型糖基化相关差异基因,并探讨其促进肿瘤发生发展的潜在机制。方法运用单色标记表达谱芯片技术对经Cosmc表达质粒或其空白对照质粒稳定转染的LS174T Tn(+)细胞进行检测,采用RNA杂交获得基因表达谱数据,通过Wegstalt平台的基因通路富集(gene set enrichment analysis, GESA)方法行GO基因本体(gene ontolog

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