【摘 要】
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减数分裂重组并非以统一的频率发生在基因组上,而是在某些区域重组频率较高,在另一些区域重组频率较低。减数分裂重组位点的刻画与识别对于认识重组机制具有重要意义。提出了
【基金项目】
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辽宁省自然科学基金项目(201602005),辽宁省高等学校创新团队(LT2014024),辽宁省食品安全重点实验室开放课题(LNSAKF2011034)
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减数分裂重组并非以统一的频率发生在基因组上,而是在某些区域重组频率较高,在另一些区域重组频率较低。减数分裂重组位点的刻画与识别对于认识重组机制具有重要意义。提出了一种新的DNA序列的3-D图形表示,并将其与Z-曲线相结合,借助正规化的ALE指标,用13维特征向量来刻画DNA序列进而进行减数分裂重组位点识别。以支持向量机作为分类器,利用夹克刀方法进行交互验证,所提方法的总精确度Acc达到了9370%,相关系数MCC达到了0873。这个结果表明此方法可作为减数分裂重组位点识别领域的一个有力工具。
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