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目的针对2008-2010年湖南省哨点医院手足口病实验室检测结果及其基因特征进行分析,为湖南省手足口病的综合防治提供参考资料。方法收集湖南省哨点医院2008-2010年手足口病病例送检的咽拭子、粪便等标本,用RD、Hep-2细胞对标本进行病毒分离,应用RT-PCR及Real ti me-PCR技术检测原始样本和分离阳性毒株中的肠道病毒71型(EV71)、柯萨奇病毒A组16型(CVA16)、非EV71和CVA16的其它肠道病毒(EV),将分离到的EV71采用RT-PCR方法进行VP1编码区基因扩增,并对扩增产物进行序列测定和分析。结果 2008-2010年湖南省哨点医院HFMD患者2 448例的各类标本中检测到EV71病毒阳性1 228份,CVA16病毒阳性169份,EV71和CVA16病毒核酸同时阳性12份,非EV71和CVA16的其它肠道病毒(以下简称为EV)阳性518份,病原谱构成以EV71型为主,其构成比为63.73%(1 228/1 927),其次EV占26.88%(518/1 927)、CVA16占8.77%(169/1 927)、EV71+CVA16混合感染占0.62%。三种不同型别肠道病毒在每月中均有报告,EV71为优势病原体,4-7月达到峰值,其次为EV型,CVA16型每月维持在低水平的感染。HFMD病例人群男性高于女性(1.95:1),1~3岁儿童是重症病例数及死亡病例数最多年龄段;湖南省14个地市(州)HFMD的病原谱均以EV71型为主。对845份阳性标本进行病毒分离,共获得肠道病毒211株,其中EV71型131株,CVA16病毒19株,非EV71和CVA16的其它EV型49株,混合感染12株。13株EV71 VP1编码区全长序列之间核苷酸同源性为97.35%~100%,氨基酸同源性为98.2%~100%,基因型为C4a亚型。结论 EV71型是2008-2010年湖南省手足口病流行的主要病原,也是引起手足口重症病例和死亡病例的主要毒株类型,属于C4a亚型。