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对番茄RAPD分析的有效引物与Operon引物系列(OP系列)的3′端序列作了统计比较。研究结果指出，番茄有效引物系列不是OP系列的随机样本,而是3′端序列的种类和分布上有偏倚性的选择性样本。虽然两个系列的引物都具有3′端同序现象,但对其分布频率正交比较结果差异极显著,此类同序性3′端在番茄基因组的RAPD座位中是普遍分布的。RAPD引物3′端序列的非随机分布，反映了番茄基因组内的多态性区段侧翼具有序列的特异性,这种特异性结构应是番茄基因组序列的一种属性，这种属性为番茄属基因组所共有。