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目的研究耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)的耐药性及其基因分型。方法收集某院2014年1月—2015年11月检出的非重复金黄色葡萄球菌967株,检测其药敏结果及mecA抗性基因、杀白细胞素(PVL)基因;MRSA菌株经多重PCR进行葡萄球菌盒式染色体mec(SCCmec)分型、多位点序列分型(MLST)、金黄色葡萄球菌蛋白A基因(spa)分型、金黄色葡萄球菌附属因子调节子(agr)分型。结果 967株金黄色葡萄球菌共检出210株MRSA,MRSA检出率为21.72%;痰标本MRSA检出率高于皮肤软组织标本(68.09%vs 11.83%,P<0.05);金黄色葡萄球菌中未发现对万古霉素和利奈唑胺耐药菌株,MRSA对庆大霉素、四环素、红霉素、克林霉素、左氧氟沙星、环丙沙星、莫西沙星、呋喃妥因、利福平的敏感率均低于MSSA,差异均有统计学意义(均P<0.05);MRSA对复方磺胺甲口恶唑的敏感率高于MSSA,差异有统计学意义(P<0.05)。皮肤软组织分离的MRSA对庆大霉素、左氧氟沙星、环丙沙星、莫西沙星、利福平的敏感率为86.90%~95.24%,而痰分离的MRSA仅为1.56%~15.63%。967株金黄色葡萄球菌检测出210株携带mecA基因,10株携带PVL基因,210株MRSA中有8株未分型,占3.81%。MLST主要以ST239(177株)为主;SCCmec分型主要以Ⅲ型(177株)为主;spa分型主要以t 030(177株)为主;agr分型主要以Ⅰ型(196株)为主。结论该院MRSA菌株主要流行克隆ST239-MRSA-SCCmecⅢ-t030,耐药形势严峻,应加强医院内耐药菌株的监测。