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加强协同研究是提升科研创新绩效的必要路径，知识结构、组织结构、评价结构等结构性问题影响着高校协同研究，表现为理论创新和知识增值缓慢。文章通过对结构性问题的分析，认为制度引导方向问题阻碍着知识结构的优化、组织结构的开放和评价结构的完善，而克服制度障碍需要政府的介入、高校的主动和企业、社会团体的紧密合作。应以高校整合人才资源、打造特色优势研究团队；激励产学研合作、建立协同创新的利益机制；改善成果质量评价方式，促进协同研究。