基于加权Context建模的DNA序列压缩算法

来源 :昆明学院学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:LittleE1032
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给出一种基于自适应Context加权的细菌DNA序列压缩算法。不同阶数的Context模型用于描述碱基符号间的关联程度。通过加权的方式将各阶模型进行组合,构建用于驱动算术编码器的条件概率分布。各阶模型对应权值由其相应自适应码长决定。在编码过程中,权值能够根据各阶模型获得的统计计数值自适应更新。实验结果表明,该方法能够获得比其他加权Context建模基因组序列压缩算法更好的压缩效率。
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