巨噬细胞与单核细胞的细胞骨架调控相关的差异基因表达

来源 :贵州医科大学学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：woshiliuning

【摘要】

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目的:分析单核细胞(Mo)向巨噬细胞(Mφ)分化的过程中,细胞骨架的调控相关基因及信号通路的表达变化。方法:CEO数据库获得Mo和Mφ的芯片数据,经RStudio软件分析获得差异表达基

【作者】

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宋咏刚胡文慧余鹏石玉玲赵雪胡祖权王赟曾柱

【机构】

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贵州医科大学基础医学院,贵州医科大学贵州省免疫细胞与抗体工程研究中心生物与医学工程重点实验室,贵州医科大学生物与工程学院

【出处】

：

贵州医科大学学报

【发表日期】

：

2019年12期

【关键词】

：

巨噬细胞单核细胞细胞骨架生物信息学基因芯片 macrophagemonocytecytoskeletonbioinformaticsgene chip

【基金项目】

：

国家自然科学基金(11762006,31771014,31660258,31860262),贵州省自然科学基金资助项目[黔科合基础(2018)1412],[黔科合平台人才(2016)5676],[黔科合人才团队(2015)4021],[黔科合平台人才(2017)5718],2011协同创新中心[黔教合协同创新字(2015)04],贵州省细胞与基因工程创新群体[黔教合KY字(2016)031]

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目的:分析单核细胞(Mo)向巨噬细胞(Mφ)分化的过程中,细胞骨架的调控相关基因及信号通路的表达变化。方法:CEO数据库获得Mo和Mφ的芯片数据,经RStudio软件分析获得差异表达基因(DEGenes),利用STRING在线工具对DEGenes构建蛋白质相互作用网络(PPI),Cytoscap软件筛选出DEGenes的核心模块;对筛选出的DEGenes的核心模块进行GO和KEGG分析。结果:Mφ相对于Mo的差异表达基因共476个,主要涉及的信号通路包括NOD样受体信号通路和吞噬体信号通路,这些通路中CC

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