【摘 要】
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目的探讨昼夜相关转录抑制因子(CIART)在肝癌组织中的表达及其与肝癌患者临床特征和预后间的相关性。方法基于癌症基因组图集(TCGA)数据库与人类蛋白质图集(HPA)数据库,比较C
【机 构】
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武汉大学人民医院肝胆腔镜外科; 消化系统疾病湖北省重点实验室; 襄阳市中心医院普外科;
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目的探讨昼夜相关转录抑制因子(CIART)在肝癌组织中的表达及其与肝癌患者临床特征和预后间的相关性。方法基于癌症基因组图集(TCGA)数据库与人类蛋白质图集(HPA)数据库,比较CIART在肝癌组织和正常肝组织中mRNA及蛋白水平的表达量;分析CIART mRNA表达量与肝癌患者临床特征及预后间的相关性;利用c Bio Portal在线平台分析CIART基因拷贝数变异及其启动子区DNA甲基化情况;采用基因集富集分析(GSEA)研究CIART基因表达水平与京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路基因集的相关性。结果 CIART在肝癌组织中mRNA和蛋白水平表达量均较正常肝组织呈现上调,且CIART mRNA表达量对肝癌具有较好的诊断效能(AUC=0. 7794,P <0. 01)。除患者性别(P <0. 01)外,CIART mRNA表达量与肝癌患者其余临床病理特征间无显著关联(P均> 0. 05)。Kaplan-Meier分析及Cox回归分析提示,CIART mRNA高表达是影响肝癌患者总体生存率和无复发生存率的独立危险因素(P均<0. 05)。370例肝癌患者中有42例(11. 35%)存在CIART基因扩增变异,且与CIART mRNA上调显著相关(P <0. 05)。此外,370例肝癌患者CIART启动子区DNA甲基化程度与CIART mRNA表达量呈显著负相关(Pearson’s r=-0. 7126,P <0. 01)。GSEA分析显示,高表达CIART样本中存在基础转录因子(BASAL_TRANSSCRIPTION_FACTORS)通路和碱基切除修复(BASE_EXCISION_REPAIR)通路基因集的富集(P均<0. 05)。结论 CIART可能作为一种癌基因参与肝细胞癌的发生、发展,并具有成为肝细胞癌诊断标志物、预后指标及治疗靶点的潜在价值。
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