【摘 要】
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目的 探索小柴胡汤防治新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的活性成分及作用机制,为小柴胡汤在COVID-19防治中的应用提供参考.方法 通过TCMSP数据库检索小柴胡汤的化学成分,将各化学成分与ACE2、MPro和PLP进行分子对接,预测其在抑制新型病毒感染和复制方面的活性;采用TCMSP和CTD数据库检索小柴胡汤化学成分的靶点,使用String数据库进行蛋白-蛋白相互作用分析得到核心靶点,通过Cytoscape软件构建“药材-活性成分-核心靶点”网络,并进行拓扑分析和对核心靶点进行KEGG通路富集分析,
【机 构】
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中山大学生命科学学院,广东省中药上市后质量与药效再评价工程技术研究中心/广东省热带亚热带植物资源重点实验室,广州510275
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目的 探索小柴胡汤防治新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的活性成分及作用机制,为小柴胡汤在COVID-19防治中的应用提供参考.方法 通过TCMSP数据库检索小柴胡汤的化学成分,将各化学成分与ACE2、MPro和PLP进行分子对接,预测其在抑制新型病毒感染和复制方面的活性;采用TCMSP和CTD数据库检索小柴胡汤化学成分的靶点,使用String数据库进行蛋白-蛋白相互作用分析得到核心靶点,通过Cytoscape软件构建“药材-活性成分-核心靶点”网络,并进行拓扑分析和对核心靶点进行KEGG通路富集分析,预测小柴胡汤防治COVID-19的作用机制.结果 分子对接结果表明,小柴胡汤的化学成分中与ACE2、MPro和PLP对接结果Libdockscore＞ 120的活性成分个数分别为86,114和105,如甘草苷E与ACE2、MPro和PLP均具有较好的结合活性,柴胡皂苷C的苷元和人参皂苷Rh2与ACE2有较高的结合活性,曲克芦丁和原卟啉与MPro具有高的结合活性,菠菜甾醇和鲨烯与PLP具有高的结合活性.网络拓扑分析筛选得到118个核心靶点,关键靶点涉及PTGS2、AR、MAPK14、PPARG和GSK3B等,与核心靶点相关联的活性成分共124个,如槲皮苷、汉黄芩素、山柰酚、异鼠李素和儿茶酸等.通路富集得到InfluenzaA、Small cell lung cancer、TNF、Toll-like receptor、PI3K-Akt和HIF-1等关键信号通路.结论 小柴胡汤中的活性成分群发挥防治COVID-19的作用机制主要包括以下3个方面:①活性成分可能通过作用于ACE2、MPro和PLP靶点抑制病毒感染宿主细胞及自我复制的进程;②通过作用于PTGS2、TNF-α和IL-6等靶点抑制细胞因子风暴;③通过调控HIF-1信号通路改善低氧血症.
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