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以对羟基苯丙酮酸双氧化酶(HPPD)的晶体结构为模板,利用同源模建方法构建了与其高度同源、底物相同但催化功能存在明显差别的对羟基杏仁酸合成酶(HMS)的三维结构,并对模建结构的合理性进行了分析.在模建结果的基础上,对HPPD和HMS分别与底物羟苯基丙酮酸(HPP)进行分子对接计算,比较了二者结合模式的异同,为两种同源酶在催化方面差异性的合理阐释提供了一些有益的信息.