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目的
对从某活禽市场环境中分离出的1株H5N6亚型禽流感病毒(A/environment/Zhenjiang/C13/2013，en/c13)进行全基因组序列测定，以揭示其基因起源和分子遗传特征。
方法采用二代测序技术对该分离株进行全基因组测序，MEGA6.0软件进行序列比对和构建系统发生树。
结果分离株NA基因与近年来中国禽类中流行的H6N6亚型禽流感的NA基因处于同一进化分支，其他7个基因(PB2、PB1、PA、HA、NP、M和NS)都与近年来东亚地区流行的H5N1亚型禽流感的相应基因处于同一进化分支，分离株en/c13的HA蛋白裂解位点为PLREKRRKR↓GLF，是高致病性禽流感病毒的典型分子特征序列。HA蛋白上关键受体结合位点226和228位(按照H3亚型的HA蛋白序列排序)氨基酸分别是Gln和Gly，是典型的禽流感病毒受体结合特征。
结论本研究从环境中分离到一株新的基因重配禽流感病毒，其中NA基因来源于H6N6禽流感病毒，而其他7个基因则来源于H5N1禽流感病毒。结果提示我国禽流感病毒基因重配频繁，进化活跃，需要加强对禽流感病毒的持续监测。