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采用经过优化后的DNA—AFLP分析体系，分析了春兰原变种与线叶春兰花基因组上的差异．9对引物组合在100～800bp之间共扩增出389条带．其中共有条带318条，春兰原变种有11条特异性条带，而线叶春兰有60条特异性条带．线叶春兰特异带的48．3％集中500～800bp，51．7%集中在100～500bp，春兰原变种特异带全部集中500～800bp．通过对不同引物分析发现引物对（E—AGC／M—CAT）对春兰原变种以及线叶春兰的特异性片段选择性较好．两种兰花花基因组上的差异可能与两种兰花花形态，以及香味