没顶淹涝早期水稻基因差异表达分析

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水稻(Oryza sativa L)耐淹品种FR13A在分蘖期进行没顶淹涝处理。分别取淹涝0h,2h,4h,8h,16h,32h的叶片进行mRNA差异显示分析,获得8个差异表达的cDNA片段。利用反式Northern斑点杂交法去除4个假阳性片段,对4个阳性片段(DF8、DF9、DF10、DF11)测序后进行同源性分析,其中一个片段(DF8)的蛋白产物与WD-40重复蛋白高度同源,另一个片段(DF11)的蛋白产物与植物生长素应答蛋白有较高同源性,其余2个没有找到同源蛋白质序列。
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