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采用ISSR分子标记技术,对菊科兔耳风属杏香兔耳风(Ainsliaea fragrans Champ)、红背免耳风(A.rubrifolia Franc)和铁灯兔耳风(A.macroclinidioides Hag)等3个极易混淆的近缘种进行了分子鉴别。从100条ISSR UBC系列引物中筛选出20条多态性好的引物进行检测,其中利用引物UBC807、UBC826、UBC834、UBC843、UBC853、UBC895的扩增特异性条带制成ISSR指纹图谱,完全可以用于3个近缘种的鉴别。此外,基于相似系数的U