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链式DEA模型研究科技投入产出两阶段效率时，忽视了阶段投入和成果产出之间的关联度，也没有就两阶段段效率对整体效率的促进作用进行检测，易造成投入因子和产出结果关联耦合度不足。在对各阶段的投入要素和成果产出进行灰色关联度分析的基础上，运用链式DEA模型对我国28个省市高技术产业的两阶段科技投入产出数据进行实证分析。然后借助单因子回归模型检验阶段效率对整体效率的作用。最后根据实证结果把各省市分为效率兼优型等四个类型。并针对性地提出政策建议。