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针对创新驱动发展战略下我国区域低碳创新网络发展面临的可持续转型增长的问题与挑战以及外部环境对效率影响作用,构建包含非期望产出的区域低碳创新网络效率评价体系,基于我国2006-2015年区域面板数据,利用改进的J-SBM三阶段DEA模型测算区域低碳创新网络效率,探讨环境因素和随机干扰对区域低碳创新网络效率的影响机理以及低碳创新网络的生产模式,在方法和内容上揭示我国低碳创新网络发展面临的挑战形势中的“黑箱”.研究表明:环境因素和随机干扰对投入松弛变量的影响存在异质性,且在未考虑环境因素和随机干扰时绝大多数地区的低碳创新网络效率被低估;我国区域低碳创新网络效率呈稳步上升态势,北京、上海两个地区位于效率的前沿面上,大多数地区仍有较大的提升空间;我国区域低碳创新网络的生产模式位于“低投入低效率”象限的比例最大.