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杂交水稻育种的实质是配合力育种，筛选高特殊配合力的杂交水稻组合才能选育出在生产上有实用价值的强优势组合。文章利用SSR标记检测了9个三系杂交稻亲本（5个不育系和4个恢复系）之间的遗传距离，结合20个杂交稻组合（5×4NCⅡ）的产量表现，分析了杂交水稻特殊配合力（Specialcombiningability,SCA）效应-7产量杂种优势、亲本间遗传距离的相关性。结果表明，特殊配合力效应与对照优势（相关系数r1=0．5609）、平均优势（相关系数r2=0．541）之间均呈显著正相关，而与亲本遗传距