甘草GuSOD基因家族的鉴定及表达分析

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超氧化物歧化酶(SOD)是抵御氧化损伤的第一道防线,在植物生长发育和各种非生物胁迫反应中起着关键作用。为了进一步研究甘草GuSOD基因家族的特点,本研究通过生物信息学方法对GuSOD基因家族进行鉴定和特征分析,并且利用转录组数据分析7个GuSOD基因在盐、低磷和干旱处理下的表达情况。结果显示:GuSOD基因家族共有7个成员,其中有4个Cu/ZnSOD (GuCSD1~GuCSD4)、2个FeSOD (GuFSD1, GuFSD2)和1个GuMSD,并且4个Cu/ZnSOD成员均具有Sod-Fe-Cu结构域,Fe-MnSOD成员具有Sod-Fe-C和Sod-Fe-N结构域。GuSOD基因家族氨基酸数目在129~441 aa之间,蛋白分子量在13.69~49.23 kD之间,等电点分布在5.68~9.23之间。亚细胞定位分析显示所有Cu/ZnSOD成员及GuFSD1位于叶绿体,GuFSD2和GuMSD位于线粒体。GuSOD基因启动子区分布与胁迫响应、激素调节、光响应等相关顺式作用元件。转录组数据分析显示,7个GuSOD基因在盐、低磷和干旱处理下大部分被诱导上调。上述结果显示GuSOD基因家族在逆境胁迫中起调控作用,该研究结果为甘草SOD基因家族的功能验证提供理论基础。
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