海南岛两株甲病毒基因组3'末端核苷酸序列的克隆与分析

来源 :中华实验和临床病毒学杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:winnerlb
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目的 从分子水平鉴定海南省分离的两株甲病毒(HBb17和M1病毒)。方法 采用RT-PCR方法 ,分别扩增两株病毒基因组的3'末端核苷酸序列,扩增产物经亚克隆,筛选重组子并测定核苷酸序列对序列进行分析。结果 HBb17和M1病毒分别扩增出约1.6kb和1.3kb的特异片段。序列分析表明,在3'末端非翻译区HBb17病毒与罗斯河病毒(国际标准株T48病毒)核苷酸同源性为99%,M1病毒与鹭山病毒(SAG)同源性为98%;两病毒结构基因的E1区序列,HBb17病毒与罗斯河病毒核苷酸(氨基酸)同源性为99%(99%),M1病毒与鹭山病毒核苷酸(氨基酸)同源性为97%(99%),M1病毒与盖塔病毒同源性为94%(98%)。结论 序列分析表明,海南岛分离的HBb17病毒属于罗斯河病毒,M1病毒可能是鹭山病毒或盖塔病毒的变异株。
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