同源重组修复检测的评价

来源 :分子诊断与治疗杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:AdamMYS
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目的 使用人实体瘤多基因突变联合检测试剂盒,对国家参考品进行同源重组修复基因(HRR)检测,评价试剂盒的HRR检测能力.方法 使用超声打断仪将参考品基因组DNA打断到180~220 bp.将片段化DNA进行末端修复、加接头和PCR扩增等步骤后制备预文库;然后杂交捕获后获得终文库;最后使用NextSeq550Dx测序仪进行测序.结果 国家参考品标示的BRCA基因突变位点以及突变的外显子位置均能准确检出,而且没有检出其他非标示的致病性或疑似致病性突变位点.试剂盒虽然对部分BRCA基因突变位点的解读结果与标示的解读结果有差异,但是解读结果也符合国家参考品的准确性要求.试剂盒未对其他的HRR基因突变进行解读.结论 HRR检测对BRCA基因突变按照BRCA基因解读规则进行解读,对其他的HRR基因突变的解读结果需要制定相应的解读规则.
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病原宏基因组高通量测序(mNGs)不依赖于传统的微生物培养,直接对临床样本中的核酸进行高通量测序,具有无偏倚、广覆盖、快速等优点.检测临床样本中的较多病原微生物(包括病毒、细菌、真菌、寄生虫),在重症感染领域,特别是疑难、罕见病导致的重症感染中发挥了关键作用.然而,感染性的临床样本多种多样,样本前处理及核酸提取方法并没有标准规范.各专家共识中也都指出样本前处理和核酸提取为mNGS技术流程的质量控制的重要节点.且相比有菌部位的标本,无菌部位的标本(静脉血、脑脊液、胸腔积液、组织)具有更高的临床价值,应尽量送
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