【摘 要】
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筛选优良根际促生菌株,定位其关键功能基因,对菌株的改造及实际应用具有重要意义.本文以解盐促生菌Enterobacter hormaechei Wu-15为材料,采用第二代和第三代测序技术对该菌株进行全基因组测序,并对其解盐促生相关的基因进行解析.结果表明,植物根际促生菌Wu-15基因组全长为4614006 bp,GC含量55.80％,含有4240个蛋白编码基因;GO、COG和KEGG数据库注释结果表明基因组中含有多种解盐促生相关基因;通过比对分析,筛选出与解盐促生功能相关的基因(溶磷相关基因7个、渗透调节
【机 构】
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石河子大学化学化工学院,新疆 石河子832003;石河子大学化学化工学院,新疆 石河子832003;西安工程大学环境与化学工程学院,陕西 西安710048
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筛选优良根际促生菌株,定位其关键功能基因,对菌株的改造及实际应用具有重要意义.本文以解盐促生菌Enterobacter hormaechei Wu-15为材料,采用第二代和第三代测序技术对该菌株进行全基因组测序,并对其解盐促生相关的基因进行解析.结果表明,植物根际促生菌Wu-15基因组全长为4614006 bp,GC含量55.80％,含有4240个蛋白编码基因;GO、COG和KEGG数据库注释结果表明基因组中含有多种解盐促生相关基因;通过比对分析,筛选出与解盐促生功能相关的基因(溶磷相关基因7个、渗透调节物质相关基因14个、逆向转运蛋白相关基因6个、IAA合成相关基因ipdC、ACC脱氨酶相关基因dcyD).本研究通过基因筛选及分析,从分子水平证明该菌株解盐促生的能力,为菌株的进一步优化改良提供指导,为该菌株在农业生产中的应用奠定基础.
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