【摘 要】
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Opaque2(O2)是一个调控玉米胚乳发育的重要转录因子.为了揭示O2的转录调控网络,利用DAP-Seq技术挖掘其在全基因组范围上结合位点共检测到11385个位点.通过结合已报道RNA-Seq
【机 构】
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江苏省农业生物学重点实验室,广州大学生命科学学院广州高等教育中心,江苏省盐城市新洋农业试验站,盐城师范学院海洋与生物工程学院
【基金项目】
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国家重点研究发展计划(2016YFD0101002);国家自然科学基金(31701453);江苏省重点研究开发项目(BE2017365)资助
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Opaque2(O2)是一个调控玉米胚乳发育的重要转录因子.为了揭示O2的转录调控网络,利用DAP-Seq技术挖掘其在全基因组范围上结合位点共检测到11385个位点.通过结合已报道RNA-Seq数据,本研究DAP-Seq共检测到317个O2直接结合并调控的靶基因,其中包括97个已报道ChIP-Seq检测靶基因以及220个DAP-Seq特异检测的靶基因.而基序(motif)富集分析显示, DAP-Seq检测O2结合317靶标基因与220个特异结合靶标基因所富集的基序均与已报道O2结合motif相同.另外,
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