水生态监测与评价是水生态系统管理、保护和可持续利用的基础。上世纪80年代开始，欧美发达国家水环境管理政策开始强调生态保护，重视流域水生态质量，先后开展了以水生生物为核心的河流水生态监测与评价研究计划。然而我国目前流域水环境监测与评价的指标主要以传统的理化监测指标为主，缺乏指示水生态变化的水生生物指标，单一的水质改善已经无法反应水生态环境好转这一长远目标，不能满足“十四五”水生态环境管理由以水污染防治为主向水环境、水生态、水资源“三水”统筹转变的总体要求。本研究系统分析发达国家和地区（如美国、欧盟、澳大利亚等）水生态监测与评价技术体系与业务化运行方面的先进经验，总结梳理我国水生态监测与评价试点已有的工作基础，分析制约我国当前流域水生态监测与评价的关键问题，从保护目标、管理模式、监测网络、科学研究、公众参与等五个方面，提出开展我国流域水生态监测与评价体系构建和业务化运行的有关建议，为准确评估和预测流域水生态质量状况的变化、开展保护修复成效评估提供决策支持和重要参考。