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目的：利用重复共有序列（ERIC）和变性梯度凝胶电泳（DGGE）两种分子指纹图谱技术对2型糖尿病患者肠道菌群结构特征分析，探讨2型糖尿病与肠道菌群的相关性及对两种方法的评价。方法收集8例健康人和7例2型糖尿病患者粪便样本，提取粪便菌群总 DNA，采用 ERIC-PCR 和 DGGE-PCR 分子指纹图谱技术对两组人群肠道菌群结构分析，比较其多样性、相似性等生态学特征。结果与健康对照组比较，2型糖尿病患者肠道菌群图谱条带和 Shannon-Wiener 多样性指数降低，但无统计学意义；组内相似性降低差异有统计学意义（P ＜0.05），菌群结构发生变化；两种指纹图谱技术均能直观反映肠道菌群结构特征，ERIC 方法简便，反映菌群多样性良好，但是实验影响因素较多，不可切胶测序；DGGE 能较好反映菌群多样性、相似性等生态学特征，而且可选择条带切胶测序。结论2型糖尿病患者肠道菌群组成结构发生改变，糖尿病的发生与肠道菌群有一定相关性；ERIC 和 DGGE 是研究肠道菌群分辨效率高、重复性好的指纹图谱技术， DGGE 并可进行切胶测序比对鉴定细菌，二者可结合使用。