【摘 要】
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目的 了解2种肺炎克雷伯菌DNA旋转酶A亚单位喹诺酮耐药决定区变异型与各种底物的结合能力.方法 参照野生型作同源建模获得2种肺炎克雷伯菌DNA旋转酶A亚单位变异型(Ⅰ型和FH型)立体结构,ArgusLab 4.1软件中的DOCK模块做DNA旋转酶A亚单位野生型和2种变异型与7种喹诺酮类药物分子对接,计算酶与底物结合自由能值(△G),并计算DNA旋转酶A亚单位氨基酸残基与环丙沙星相互作用原子对数量及
【机 构】
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214026无锡新区虎马生物信息工作室无锡市克隆遗传技术研究所,宁波市第一医院检验科,上海市生物信息技术研究中心
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目的 了解2种肺炎克雷伯菌DNA旋转酶A亚单位喹诺酮耐药决定区变异型与各种底物的结合能力.方法 参照野生型作同源建模获得2种肺炎克雷伯菌DNA旋转酶A亚单位变异型(Ⅰ型和FH型)立体结构,ArgusLab 4.1软件中的DOCK模块做DNA旋转酶A亚单位野生型和2种变异型与7种喹诺酮类药物分子对接,计算酶与底物结合自由能值(△G),并计算DNA旋转酶A亚单位氨基酸残基与环丙沙星相互作用原子对数量及距离.结果 肺炎克雷伯菌DNA旋转酶A亚单位变异型Ⅰ型、FH型与吡哌酸、环丙沙星、加替沙星结合自由能值分别为-26.607 50、-29.530 39、-29.493 09 kJ/mol,-26.696 44、-28.972 83、-29.590 50 kJ/mol;野生型分别为-27.188 82、-30.872 00、-30.244 04 kJ/mol,即吡哌酸、环丙沙星、加替沙星与2种变异型结合力下降,呈现耐药.Ⅰ型、FH型与左氧氟沙星结合自由能值为-29.013 81、-29.497 57 kJ/mol,野生型为-28.016 20 kJ/mol.Ⅰ型、FH型与萘啶酸、诺氟沙星、氧氟沙星结合自由能值有升有降.DNA旋转酶A亚单位野生型、Ⅰ型、FH型与环丙沙星相互作用形成原子对距离在5×10-10 m以内的分别有16对、2对和4对；形成原子对距离在4×10-10 m以内的只有8对,均为野生型.结论 肺炎克雷伯菌DNA旋转酶A亚单位2种变异型与环丙沙星结合力下降是耐药的形成因素。
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