【摘 要】
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[目的]本文旨在了解大白猪转化生长因子β1(TGF-β1)基因第4内含子序列特征,分析其突变位点多态性与繁殖性能的关系及潜在机制.[方法]利用PCR扩增和测序技术获得大白猪TGF-β1基因第4内含子序列,用生物信息学软件分析序列特征;利用DNA混池测序技术筛选目标序列突变位点,用直接测序法进行基因分型,用SAS软件对突变位点多态性与繁殖性能进行关联性分析;利用克隆测序技术测定不同基因型个体卵巢颗粒细胞中TGF-β1基因编码区序列,分析突变对mRNA剪接的影响.[结果]大白猪TGF-β1基因第4内含子序列全
【机 构】
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南京农业大学动物科技学院,江苏 南京210095;宿豫区正博生猪养殖场,江苏 宿迁223800
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[目的]本文旨在了解大白猪转化生长因子β1(TGF-β1)基因第4内含子序列特征,分析其突变位点多态性与繁殖性能的关系及潜在机制.[方法]利用PCR扩增和测序技术获得大白猪TGF-β1基因第4内含子序列,用生物信息学软件分析序列特征;利用DNA混池测序技术筛选目标序列突变位点,用直接测序法进行基因分型,用SAS软件对突变位点多态性与繁殖性能进行关联性分析;利用克隆测序技术测定不同基因型个体卵巢颗粒细胞中TGF-β1基因编码区序列,分析突变对mRNA剪接的影响.[结果]大白猪TGF-β1基因第4内含子序列全长189 bp,含有1个微卫星(GT)6和多个顺式作用元件结合位点,与杜洛克猪相应序列的一致性为98.94％.在第4内含子63～64核苷酸处(TGF-β1基因的8666～8667核苷酸处)发现一个2 bp序列的插入/缺失突变,命名为g.8666_8667delAC.在大白猪群体中发现3种基因型(ins/ins、ins/del和del/del),其中ins/ins为优势基因型(57.8％).关联性分析发现,ins/del基因型母猪的初产死胎数(NSB)显著高于另2种基因型(P0.05).克隆并测序后发现ins/ins基因型和ins/del基因型母猪卵巢颗粒细胞中TGF-β1基因编码区序列长度一致.[结论]TGF-β1基因是大白猪繁殖性状的候选基因,g.8666_8667delAC位点del/del基因型是总产仔数(TNB)的有利基因型,ins/del基因型母猪初产死胎数(NSB)较高;g.8666_8667delAC位点突变不是通过影响TGF-β1基因的选择性剪接来影响繁殖性能.
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