根据GenBank中猪Ⅱ型圆环病毒 （PCV₂ ）基因序列 ,设计两对特异性引物。将PCV₂广东分离株 （GD1株 ）用PK15细胞系培养 ,从细胞培养物中提取病毒总DNA并以之为模板 ,用PCR方法分段扩增病毒全基因组 ,分别克隆到pMD18_T载体 ,对阳性质粒进行序列测定。用DNAstar对序列进行拼接 ,得到PCV₂GD1株基因组全序列 ,全长为 176 7个碱基 ,包涵 2个开放阅读杠 （ORF1和ORF2 ） ,分别编码与复制相关的Rep蛋白和结构蛋白Cap。通过BLAST对所测GD1株核苷核酸序列早国内外已登录GenBank中的PCV₂病毒核苷酸序更进行同源性比较 ,与PCV₂参考毒株的核苷酸同源性介于 94 4 %～ 99 7%之间 ,与德国株PCV₂ （AF2 0 1897）的同源性最高 ,为 99 7% ;与猪Ⅰ型圆环病毒 （PCV₁）参考株 （AY184 2 87）的同源性仅为 70 %。