【摘 要】
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PQ-树是一种树状数据结构,用来表示元素排列集合.虽然消逝物种完整基因组序列具有不确定性,但是根据同源物种可以确定部分基因的相对位置,所以可以利用PQ-树来存储消逝物种的
【基金项目】
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国家自然科学基金项目(61202014,61472222),山东省自然科学基金项目(ZR2012FQ008),中国博士后科学基金项目(2011M5001133,2012T50614)
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PQ-树是一种树状数据结构,用来表示元素排列集合.虽然消逝物种完整基因组序列具有不确定性,但是根据同源物种可以确定部分基因的相对位置,所以可以利用PQ-树来存储消逝物种的基因组.在生物学中,进化树用来表示物种之间的进化关系.当构建生物进化树时,叶子结点表示现存物种,其基因组用排列表示;内部结点为祖先物种,其基因组用PQ-树表示.为了确定物种间的进化关系,需要确定PQ-树可以产生的排列与已知排列之间的距离.以断点距离为标准,研究了p-PQ-树断点中心问题,即从给定PQ-树中产生一个排列,使之与给定的p个排列
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