为研究不同时空尺度下河流细菌群落结构和构建机制，于枯水期（10～翌年1月）和丰水期（4～8月）在鄱阳湖水系（五河七口）共进行8次水样采集，基于高通量测序技术分析了细菌群落结构、网络交互作用及构建机制.结果表明：Shannon指数丰水期（7.38）显著高于枯水期（6.41），Chao1指数不同水期间差异不显著，丰水期与枯水期内α多样性均存在显著差异.不同站点间细菌群落α多样性差异不显著，β多样性存在差异.假单胞菌门（Pseudomonadota，34.72%）、放线菌门（Actinobacteriota，32.35%）、蓝藻菌门（Cyanobacteria，13.21%）和拟杆菌门（Bacteroidota，10.81%）是鄱阳湖水系的优势菌门，相对于枯水期，丰水期Pseudomonadota和Actinobacteriota相对丰度显著下降，Cyanobacteria和Bacteroidota显著上升.水温（WT）和平均河网长度（MDSL）是影响门水平细菌群落结构的主要环境因子.水体细菌群落的生态网络相互协作、竞争关系并存，丰水期物种间复杂性和稳定性强于枯水期.流量（WF）、WT和溶解氧（DO）与共生网络显著相关.确定性过程主导细菌群落构建机制，枯水期确定性过程贡献强于丰水期，不同时间尺度下共生网络模式和构建机制存在一定差异.本研究可为了解不同时空下鄱阳湖水系生态系统健康发展、水资源的利用和水环境的改善提供科学参考依据.