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随着经济科技一体化和全球化的发展，科学合作越演越烈，已成为各国政府和科研机构提升自身科研水平和核心竞争力的有力途径。科学合作中的伙伴关系问题会影响科学合作的建立、顺利开展和深入进行，也引起了学者们的广泛关注。但现有研究重伙伴选择，轻伙伴关系管理。基于这一点，本文在探析相关理论的基础上，对科学合作的伙伴关系管理问题提出一些对策与建议。