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SSR和ISSR分于标记已广泛应用于研究遗传行为和基因定位。在对水稻早世代稳定遗传特性的研究中，选用分布于水稻12条染色体上的168时多态性较好的SSR引物，对28个稳定株系的F1、F2、F3及同组合的分离株系进行了SSR标记分析；选用26个多态性较好的ISSR引物对5个组合中出现的8个稳定株系及同组合的分离株系进行了ISSR分于标记。结果显示：稳定株系的标记带型出现三种类型：（1）母本带出现。父本带消失；（2）父本带出现。母本带消失；（3）出现非父母标记带型。分离株系表现为杂合标记带。推测水稻早世代稳定