【摘 要】
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目的:利用TCGA数据库筛选和分析膀胱癌肿瘤抑制基因CDKN1A的突变特征,筛选具有肿瘤新抗原特征的CDKN1A抗原突变肽并分析其在人群中的免疫反应性。方法:利用TCGA公共数据库中413例膀胱癌全外显子测序数据,根据亲和力预测和基因表达量,筛选出人类白细胞抗原(HLA)-A2限制的CDKN1A突变型肽段与野生型肽段。利用T2细胞实验检测配对肽段的结合力。采用酶联免疫斑点试验检测HLA-A2基因型膀胱癌患者外周血单个核细胞对配对抗原肽的免疫反应。结果:根据预测的突变型肽段高亲和力而野生型肽段低亲和力的原则
【机 构】
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上海交通大学医学院附属新华医院泌尿外科,上海交通大学医学院上海市免疫学研究所,同济大学生命科学院
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目的:利用TCGA数据库筛选和分析膀胱癌肿瘤抑制基因CDKN1A的突变特征,筛选具有肿瘤新抗原特征的CDKN1A抗原突变肽并分析其在人群中的免疫反应性。方法:利用TCGA公共数据库中413例膀胱癌全外显子测序数据,根据亲和力预测和基因表达量,筛选出人类白细胞抗原(HLA)-A2限制的CDKN1A突变型肽段与野生型肽段。利用T2细胞实验检测配对肽段的结合力。采用酶联免疫斑点试验检测HLA-A2基因型膀胱癌患者外周血单个核细胞对配对抗原肽的免疫反应。结果:根据预测的突变型肽段高亲和力而野生型肽段低亲和力的原则
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