TCGA数据库相关论文
本论文共分为三个部分,第一部分探究了细胞外基质(Extracellular matrix,ECM)在组织工程中的应用,并以ECM为基础开发了一种新的生物......
探讨铁死亡相关基因在肾透明细胞癌患者中的表达及其预后价值。通过TCGA数据库下载KIRC的相关测序数据与检索到的铁死亡相关基因取......
目的:通过生物信息学分析,探讨上皮间质转化(EMT)相关的长链非编码RNA(lncRNA)在乳腺癌中的预后作用。方法:从TCGA数据库下载乳腺癌的转录......
目的 研究CD155/TIGIT在骨肉瘤患者中的表达及其意义。方法 通过癌症基因组图谱(TCGA)数据库分析骨肉瘤远处转移患者和非转移患者肿......
期刊
目的 分析ABCC2基因表达水平与肺腺癌预后之间的关联性,并对其影响机制进行初步探索。方法 采用TCGA数据库和HPA数据库对肺腺癌病人......
目的 探索免疫治疗在恶性胸膜间皮瘤(malignant pleural mesothelioma,MPM)中免疫疗效相关关键分子及其可能的机制。方法 2018年7月......
研究背景与目的:在全球范围内膀胱癌是第二常见的泌尿系肿瘤,其约57万/年的新增病例,以及21万/年的死亡病例对人类健康造成巨大威......
目的:挖掘并筛选与甲状腺乳头状癌(papillary thyroid carcinoma, PTC)淋巴结转移相关的突变基因及其潜在的机制。方法:从TCGA数据库......
目的 基于癌症基因组图谱(TCGA)数据库,分析线粒体天冬氨酰-tRNA合成酶2(DARS2基因在膀胱癌患者和正常组织中的表达差异,研究其与患者......
目的:肺癌是我国发病率和死亡率最高的恶性肿瘤,具体发病机制尚不明确,早期诊断困难。肺癌最常见的病理类型为腺癌,其基因组改变复......
目的 基于癌症基因组图谱(TCGA)数据库,研究GTP酶免疫相关蛋白8(GIMAP8)在肺腺癌中的表达及与预后的关系。方法 从TCGA数据库中下载肺腺......
期刊
目的 基于TCGA数据库数据分析肺腺癌组织中扩展突触标记蛋白3(ESYT3)基因的表达变化和临床意义,并探讨其分子作用机制。方法 从TCGA数......
目的 探讨构建基于铁死亡相关长链非编码RNA(lncRNA)的预后风险模型预测肝细胞癌(HCC)患者预后的价值。方法 自癌症基因组图谱TCGA数据......
目的 筛选低级别胶质瘤(LGG)预后相关的免疫lncRNA,构建免疫相关lncRNA预后风险模型.方法 从公共数据库TCGA下载LGG转录组数据及相......
目的 通过生物信息学筛选出结肠癌中的关键基因,为结肠癌分子生物研究及早期诊断相关生物标志物筛选提供理论依据.方法 从GEO数据......
目的 利用TCGA数据库建立预测肺腺癌(LUAD)预后的自噬基因(ATG)预后模型.方法 通过R(v3.6.1)软件筛选出TCGA数据库中LUAD样本及癌......
目的 从TCGA数据库中探究肿瘤突变负荷(TMB)与膀胱癌的相关性,有助于膀胱癌免疫机制的深入研究,为膀胱癌的免疫治疗提供更多的预测......
目的通过对美国国立生物技术信息中心(National Center for Biotechnology Information,NCBI)的GEO数据库和癌症基因图谱(The Cancer ......
目的:通过获取TCGA和GEPIA数据库中的相关数据,分析精胺氧化酶(SMOX)基因在肝癌中的表达及其临床意义。方法:本文基于TCGA和GEPIA数......
目的:通过GEO(Gene expression omnibus)数据库筛选胰腺癌(Pancreatic adenocarcinoma,PAAD)差异表达基因(Differentially expressed ge......
背景:阿片类药物常用于缓解肿瘤患者的疼痛症状以及围术期麻醉镇痛和镇静。然而,阿片类药物对肿瘤生长的影响存在争议。目的:通过......
目的:通过生物信息学分析,筛选与胃癌预后相关的miRNAs,构建并验证风险评分模型。方法:1.登录人类癌症和肿瘤基因图谱(TCGA)数据库下......
目的:下载癌症基因组图谱(TCGA)数据库中胃癌(GC)m RNA表达量进行数据挖掘,找出与GC预后相关的糖酵解基因,构建风险评分模型,并评估其......
目的通过TCGA和Oncomine数据库对子宫内膜癌进行生物信息学分析,深入挖掘子宫内膜癌发生关键基因。方法从TCGA数据库中下载子宫内......
第一部分NLR对食管鳞状细胞癌(Esophageal squamous cell carcinoma,ESCC)患者术前新辅助治疗效果的预测价值研究背景:ESCC是我国高......
[目的]通过大数据分析了解NAT1mRNA和蛋白质在结肠癌中的表达情况及对临床预后的影响.[方法]检索当前世界上几个主要的肿瘤生物信......
1.2.4构建AS与SF之间的调控网络rn根据RNA-seq数据提取剪切因子(Splicing Factor,SF)的表达量,分析AS与SF在HCC肿瘤样本中的相关性......
目的:通过分析癌症基因组图谱数据库(TCGA)中肿瘤突变负荷(TMB)数据,构建并验证肝细胞癌(HCC)风险评分预后模型.方法:从TCGA数据库......
目的 分析食管鳞癌(ESCC)组织中的差异表达基因(DEGs)与预后的关系,并探索影响食管鳞癌发生的关键通路.方法 R语言limma程序对基因......
【背景及目的】在世界范围内泌尿外科临床疾病中,膀胱癌是最常见的恶性肿瘤之一。膀胱癌的发生,影响了患者的生活质量,降低了患者......
背景和目的:胶质瘤来源于神经胶质细胞,包括多形性胶质母细胞瘤、星形细胞瘤、少突胶质细胞肿瘤、室管膜细胞肿瘤、髓母细胞瘤及其......
乳腺癌是常见的女性恶性肿瘤之一,严重威胁广大妇女的身心健康。而我国乳腺癌发病率的增长速度是全球的两倍多,并且发病有年轻化的......
研究背景与目的:白细胞衍生趋化因子 2(Leukocyte cell-derived chemokine 2,LECT2)是一种分泌蛋白,最初被认为是中性粒细胞的趋化因......
目的 研究COL4A1在口腔鳞状细胞癌(OSCC)中的表达情况,以及与临床病理的关系.方法 该文通过TCGA、GEO公共数据库中的基因表达数据......
利用TCGA数据库中肾透明细胞癌的miRNA与mRNA数据及临床信息,构建由miRNA组成的预后风险评分模型,并筛选与生存预后相关的miRNA-mR......
脑胶质瘤(Glioma)是最常见的中枢系统恶性肿瘤,MAML2是NOTCH信号通路的共激活因子,通过癌基因组数据库(TCGA)分析验证MAML2基因表......
目的 通过TCGA数据挖掘和分子对接技术探讨CKS1B高表达在肺腺癌(LUAD)中的意义及芒柄花素的干预机制.方法 从TCGA公共数据库获得肺......
目的 对TCGA数据库进行挖掘,探索ABRACL在食管癌中的表达、对预后的影响及机制.方法 从TCGA和GEO数据库提取正常及食管癌组织中的A......
前列腺癌(Prostate cancer,PCa)是现阶段常见的恶性疾病之一。PCa临床表现不明显、临床检测复杂。若发展到晚期,在治疗上也会面临巨......
目的 神经元Ca 结合蛋白1(NECAB1),作为神经元Ca 结合蛋白家族的成员,通常用作各种类型神经元的标记物.之前报道了NECAB 家族的其他......
目的 研究癌症基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)数据库中结直肠癌的差异表达的lncRNA、miRNA 和mRNA,构建竞争性内源RNA(......
目的 乳腺癌转移是导致乳腺癌致死最主要的原因,有研究表明DUBs 可以通过去泛素化作用不同的靶蛋白进而能够参与乳腺癌转移过程的......
目的利用生物信息学管理对乳腺癌和癌旁组织进行长链非编码RNA-生长停滞特异基因5(lncRNA GAS5)差异表达分析,以探讨GAS5对三阴性乳腺......