水稻线粒体丝氨酸羟甲基转移酶基因的电子克隆

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【摘要】

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采用基于EST的电子克隆方法得到了一段长1611bp的cDNA序列,以此为信息探针搜索HTGs数据库,找到一个与之高度匹配的基因组DNA序列--OSJNBa0057G07克隆.用FGENESH分析该克隆中

【作者】

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刘庆坡冯英董辉

【机构】

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浙江大学农业与生物技术学院农学系

【出处】

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生物信息学

【发表日期】

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2005年1期

【关键词】

：

水稻线粒体丝氨酸羟甲基转移酶电子克隆

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采用基于EST的电子克隆方法得到了一段长1611bp的cDNA序列,以此为信息探针搜索HTGs数据库,找到一个与之高度匹配的基因组DNA序列--OSJNBa0057G07克隆.用FGENESH分析该克隆中的联配区域得到一个包含14个外显子和13个内含子的基因.该基因位于水稻第3染色体物理图谱的136.0～137.6cM区域.推导的ORF编码498个氨基酸,经BLASTP搜索SWISS-PROT数据库和蛋白序列的亚细胞定位显示,该基因编码水稻的线粒体丝氨酸羟甲基转移酶(mSHMT).该基因受到EST序列的完

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