【摘 要】
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目的 对云南省6种鹅膏菌的核糖体大亚基(nuclear large-subunit ribosomal DNA,nLSU rDNA)及内转录间隔区(internal transcribed spacer,ITS)DNA序列进行比对分析,探究其亲缘
【机 构】
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云南省疾病预防控制中心,昆明,650022
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目的 对云南省6种鹅膏菌的核糖体大亚基(nuclear large-subunit ribosomal DNA,nLSU rDNA)及内转录间隔区(internal transcribed spacer,ITS)DNA序列进行比对分析,探究其亲缘关系以找到合适的鉴定鹅膏菌DNA条形码序列的方法.方法 采用试剂盒离心柱法提取6种鹅膏菌DNA,以ITS4/ITS5作为ITS序列引物和LR5/LROR作为nLSU序列的引物进行PCR扩增,后送至华大基因科技有限公司进行测序.所返回的序列进行遗传距离分析及邻接树构建.结果 球基鹅膏、红托鹅膏与小豹斑鹅膏3种鹅膏菌亲缘关系较近.以ITS序列分析,三者遗传距离在0.0202～0.0801之间.以nLSU序列分析,三者遗传距离在0.0031～0.0303之间.黄毒蝇鹅膏与赭盖鹅膏菌H2在ITS序列中与黄毒蝇鹅膏20、21、H7、D1、D16、D24亲缘关系较近,遗传距离在0.0462～0.0479.赭盖鹅膏菌7与黄毒蝇鹅膏D14两株菌遗传距离仅有0.1528.从邻接树来看ITS序列存在种内多,聚类分析结果不稳定,明显不同的2个种聚为一支.而nLSU序列可将各种分离开.结论 建议鹅膏菌快速鉴定选用nLSU序列作为主要鉴定序列,ITS序列作为辅助序列.
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