神经细胞分化中microRNA-134靶基因网络功能分析

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目的检测micro RNA-134在神经细胞分化过程中表达量的变化,分析调控神经分化的分子机制。方法采用表皮生长因子和成纤维细胞生长因子诱导骨髓间充质干细胞向神经细胞分化,实验分为两组:对照组不加任何因子,诱导组加入表皮生长因子和成纤维细胞生长因子。通过形态、免疫组织化学和实时荧光定量聚合酶链反应(q RT-PCR)3种技术鉴定骨髓间充质干细胞向神经细胞分化的情况,并通过q RT-PCR检测micro RNA-134在神经细胞分化中表达量的变化。利用mi RWalk、DAVID、STRING和Cytoscape生物信息学软件分别对micro RNA-134靶基因进行预测,对靶基因进行GO功能富集分析,筛选与神经分化相关的基因进行蛋白网络功能分析。结果 Micro RNA-134在神经细胞分化过程中表达量上升,生物信息学分析结果显示micro RNA-134的靶基因半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶3(CASP3)、整合素β亚基1(ITGB1)、血小板活化因子乙酰水解酶1b调控子单元1(PAFAH1B1)、蛋白激酶C(PRKCA)、膜附着型本体A(EFNA2)、NK6同源框1(NKX6-1)、神经细胞黏附分子(NRCAM)、突触融合蛋白结合蛋白1(STXBP1)、钾离子通道相互作用的蛋白2(KCNIP2)、蛋白磷酸酶ABI2、CNTN2及FOXA1与神经分化有关。结论 Micro RNA-134通过作用于靶基因在神经细胞分化中起促进作用。
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