葡萄醛脱氢酶(ALDH2)基因进化、表达及启动子功能的生物信息学分析

来源 :西北农林科技大学学报(自然科学版) | 被引量 : 0次 | 上传用户:dancingkingb
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
【目的】研究葡萄醛脱氢酶ALDH2基因家族中ALDH2B4、ALDH2B8和ALDH2B9 3个成员的进化关系,对其在病原菌侵染、非生物胁迫及激素处理下的表达进行分析,为揭示ALDH2基因在植物逆境胁迫下的作用机理提供理论依据。【方法】运用生物信息学方法,鉴定葡萄ALDH蛋白序列;通过葡萄和拟南芥ALDH2基因的系统发育树、基因结构及同线性分析探讨其进化关系;利用葡萄Affymetrix芯片数据,分析葡萄ALDH2(ALDH2B4、ALDH2B8和ALDH2B9)基因在病原菌侵染、非生物胁迫和激素处理下的表达谱;采用在线软件PlantCARE分析3个葡萄ALDH2基因的启动子元件组成差异。【结果】在葡萄基因组中共鉴定出23个ALDH基因,并发现了ALDH2基因的可变剪接现象。基因结构分析结果表明,3个葡萄ALDH2基因的内含子/外显子组成高度相似,且均是通过大规模基因倍增产生的;仅有ALDH2B4具有剪接变体。葡萄与拟南芥的ALDH2基因位于同线区域,表明葡萄与拟南芥的ALDH2基因具有共同的祖先,ALDH2基因先于植物分化而存在。表达分析结果表明,VvALDH2B8是一个多病原菌和非生物胁迫响应基因,VvALDH2B4是一个渗透胁迫响应基因。葡萄的3个ALDH2基因的启动子区域均含有逆境胁迫响应元件,在VvALDH2B8上还发现了病原菌侵染响应元件Box-W1。【结论】葡萄的3个ALDH2基因虽然具有共同的祖先,但其在逆境条件下的表达差异很大,VvALDH2B8和VvALDH2B4可能在植物抵抗逆境胁迫中起重要作用。
其他文献
为了延长洋桔梗的花期,本研究通过农杆菌介导法,以ACC合酶(ACS)基因干扰表达载体,对Double Mariachi Pink洋桔梗(Eustoma grandiflorum)的叶片外植体进行了转化.经过再生芽的
介绍了上海市政府大楼平改绿工程的技术难点及针对不同区域采用的翻修处理方案,总结了平改绿项目的施工经验。
6月25日,遵义市“遵品入沪”消费扶贫暨蔬菜产业发展现场推进会在道真举行。会上成立了沪遵消费扶贫联盟并发布了《遵义农产品流通销售标准指南》1.0版。$$近年来,贵州发展茶
报纸
【摘要】目的对比研究聚桂醇、无水乙醇及生理盐水经超声介入硬化治疗荷瘤肝癌模型的作用效果,探讨聚桂醇能否成为治疗原发性肝癌的新型硬化剂。 方法取BALB/C裸鼠30 只及人
目的:筛选败酱草抗肝硬化的活性部位。方法:采用系统溶剂法提取败酱草的不同极性部位,对不同极性部位抗肝硬化活性进行筛选,获取败酱草干预大鼠肝硬化的活性部位。结果:通过观察和
病理报告是病理医师向临床医师提供的一份诊断证据,为患者治疗的依据,也是青年医师应该掌握的基本功。文章描述了病理报告的主要内容及书写要求,分析了病理报告常见的患者信
摘要目的非酒精性脂肪肝病(NAFLD)是西方国家最常见的肝脏疾病,目前尚无筛查非酒精性脂肪肝性肝炎(NASH)进展的成本效益的研究。方法在一般人群和筛选出的肥胖或糖尿病高危人
随着现代信息的发展,远程网络教育成为老年教育的重要途径。以网络学习的老年用户为中心,研究现有老年远程教育网站存在的问题;基于用户体验,结合老年人教育需求和生理、心理
通过试验研究了沥青、软化油、SBS、PSBR等主要组分的牌号和添加量对自粘改性沥青防水卷材剥离性能的影响,确定了各组分最合适的配比,使卷材的剥离性能达到最佳。
在推进院校教育"向实战聚焦、向部队靠拢"的探索实践中,以合训专业学员培养为例,说明以培养学员计算思维能力为目标的任务驱动教学模式,从增强任务的层次性、突出任务的真实性