【摘 要】
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NF-YA是植物中一类保守的转录因子,广泛参与调控植物生长发育与响应胁迫.苹果(Malus pumila)GDDH13高质量参考基因组的释放,为本文NF-YA的全基因组分析提供了基础.基于蛋白同
【机 构】
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山东农业大学园艺科学与工程学院,作物生物学国家重点实验室,山东果蔬优质高效生产协同创新中心,山东泰安271018;中国科学院武汉植物园,中国科学院植物种质创新与特色农业重点实验室,武汉430074
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NF-YA是植物中一类保守的转录因子,广泛参与调控植物生长发育与响应胁迫.苹果(Malus pumila)GDDH13高质量参考基因组的释放,为本文NF-YA的全基因组分析提供了基础.基于蛋白同源比对与结构域模型扫描2种生物信息学方法,共筛选出11个苹果NF-YA(MpNF-YA)成员,它们均包含CBFB_NF-YA核心保守结构域,亚细胞定位预测都位于细胞核中.MpNF-YA分布于10条染色体上,具有相似的基因组结构与内含子相位组成.结构域序列比较发现,它们的保守域由2个典型区段(A1和A2)构成.遗传进化与保守基序分析表明,11个MpNF-YA分为3组,且都具有motif 1和motif2.顺式元件扫描、miRNA预测及表达模式分析暗示MpNF-YA基因受多种调控因素影响,呈现组织差异表达的特点,并且在果实发育与氮饥饿响应等环节起到重要作用.
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