【摘 要】
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目的:基于生物信息学和网络药理学探究大黄-黄连药对(RRRCR)治疗Hp感染胃肠道疾病的分子机制,阐明其靶向作用的核心基因及关键microRNA.方法:通过TCMSP数据库筛选RRRCR的活性
【机 构】
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湖南中医药大学中医诊断学湖南省重点实验室 长沙,410208
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目的:基于生物信息学和网络药理学探究大黄-黄连药对(RRRCR)治疗Hp感染胃肠道疾病的分子机制,阐明其靶向作用的核心基因及关键microRNA.方法:通过TCMSP数据库筛选RRRCR的活性成分及作用靶点;通过GEO数据库检索Hp感染胃黏膜上皮的基因表达谱芯片数据;通过R软件对芯片数据进行均一化处理并分析差异表达基因;采用STRING数据库构建成分靶点和疾病靶点蛋白质相互作用网络并提取2个网络的交集;采用DAVID对交集基因进行基因本体分析和京都基因与基因组百科全书富集分析;运用CytoHubba筛选核心基因;利用TargetScan分析关键microRNA.结果:获得21个RRRCR活性成分和217个作用靶点;GSE70394芯片数据包含Hp感染者和正常人的显著性差异表达基因128个;进一步分析得到RRRCR治疗Hp胃肠道疾病的特异性基因靶点55个;基因主要涉及免疫和炎症反应等生物过程,分子功能主要体现在TNF激活受体、细胞因子受体等,主要富集于细胞外空间、内质网膜等区域;RRRCR抗Hp感染的机制主要涉及JAK-STAT、NF-κB等信号通路.RRRCR治疗Hp相关胃肠道疾病主要作用于CXCL8、IL-10、IL-1β等10个核心基因及 microRNA-122-5p、microRNA-93-5p、microRNA-558等关键 microRNA.结论:RRRCR 可通过调控编码RNA(基因)和非编码RNA层面发挥治疗Hp相关胃肠道疾病的作用,呈现出多成分、多靶点、多通路的效应特点.
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