【摘 要】
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水稻广谱抗病基因Bsr-d1编码C2H2型锌指蛋白,本研究基于此通过RT-PCR技术从棉花中克隆4个与水稻Bsr-d1同源的C2H2型锌指蛋白基因并对其进行了生物信息学分析和表达分析,结果表明这些基因氨基酸序列与Bsr-d1的一致性为25％～35.7％,故命名为GhBsr-d1L1～GhBsr-d1L4;GhBsr-d1Ls基因的开放阅读框大小为663～813 bp,编码的氨基酸数为220～270,蛋白质分子量为23.82～28.64kD,理论等电点为7.22～8.56,不稳系数为47.7～67.17,亲
【机 构】
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新疆农业大学农学院,乌鲁木齐,830001
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水稻广谱抗病基因Bsr-d1编码C2H2型锌指蛋白,本研究基于此通过RT-PCR技术从棉花中克隆4个与水稻Bsr-d1同源的C2H2型锌指蛋白基因并对其进行了生物信息学分析和表达分析,结果表明这些基因氨基酸序列与Bsr-d1的一致性为25％～35.7％,故命名为GhBsr-d1L1～GhBsr-d1L4;GhBsr-d1Ls基因的开放阅读框大小为663～813 bp,编码的氨基酸数为220～270,蛋白质分子量为23.82～28.64kD,理论等电点为7.22～8.56,不稳系数为47.7～67.17,亲水平均数为-0.755～-0.544,无信号肽和跨膜结构域;GhBsr-d1Ls均定位于细胞核,编码N端的保守L-box结构域,C2H2型锌指结构域以及C端的转录抑制结构域EAR/DLN-box,属于陆地棉中第Ⅱ类C2H2型锌指蛋白亚家族.系统发育树分析表明,GhBsr-d1L1与GhBsr-d3L3的遗传距离最近,GhBsr-d1L2与大豆SCOF-1遗传距离最近,GhBsr-d1L4与长果种黄麻的同源基因遗传距离最近.荧光定量PCR分析表明,GhBsr-d1Ls基因在根、下胚轴及真叶中均表达,但表达量各有差异,同时在不同程度上GhBsr-d1Ls均受到大丽轮枝菌的诱导.推测GhBsr-d1Ls基因可能在棉花响应大丽轮枝菌时起重要作用.
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