芸薹属物种(B.napus,B.rapa,B.oleracea)PHB基因的生物信息学分析

来源 :分子植物育种 | 被引量 : 0次 | 上传用户:plutoBSD
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HD-ZIP Ⅲ基因家族参与植物胚胎发生、分生组织形成、叶极性建立和维管组织分化等过程.本研究利用生物信息学方法,对HD-ZIP Ⅲ成员之一PHABULOSA(PHB)进行鉴定,在甘蓝型油菜、白菜和甘蓝中共获得7个PHB成员,并对其核苷酸和氨基酸序列的基本特征、结构域、保守基序、基因结构和系统进化关系进行了分析.结果表明,这些PHB蛋白编码不稳定的亲水性蛋白,所有成员均含有Homeobox、bZIP、START和MEKHLA保守结构域,PHB位点在三个物种间的进化符合禹氏三角理论.序列分析及测序结果显示白菜的两个PHB基因在miR165、miR166结合位点处存在一个碱基差异.本研究为进一步揭示芸薹属物种PHB基因功能提供了依据.
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新疆野苹果(Malus sieversii)作为中国Ⅱ级保护植物,近年来分布面积逐渐减小,为了揭示新疆野苹果种群的生存现状,本研究在新疆野苹果典型分布区新源县交吾托海、巩留县大莫合、霍城县大西沟共设置22块样地,通过样地调查获得数据,利用静态生命表、存活曲线、生存分析函数,结合种群结构动态指数,综合分析新疆野苹果的种群动态变化,以期为新疆野苹果资源的保护利用提供理论依据.结果 表明:3个新疆野苹果种群年龄结构均呈现为不规则金字塔型,种群以中龄阶段的个体较多,缺少幼树和老树,种群存在衰退风险;3个新疆野苹果
植物转基因删除系统是以删除外源基因、选择标记基因、报告基因等为基础发展起来的分子育种技术,因其独特的技术特点,迅速在分子育种上得到了广泛的应用和发展.本研究介绍了5种基因删除技术,包括位点特异重组系统(FLP/FRT重组系统,Cre/loxP重组系统,R/RS重组系统)、共转化系统、转座子系统、染色体内同源重组4种传统的基因删除技术,以及由CRISPR/Cas9基因编辑系统介导的基因删除技术;并分析了这5种基因删除技术的基本原理、自身的优缺点及目前的实际应用研究现状.本研究挖掘了这些技术作为基因删除以外的
探讨三种类型油菜苗期的抗旱性,并筛选抗旱指标,为今后抗旱性品种选育提供参考.以甘蓝型油菜Q2、芥菜型油菜\'新油9号\'和白菜型油菜L14为材料,在温室中进行盆栽控水实验,设置正常供水和干旱胁迫处理,测定油菜叶片光合参数、叶绿素荧光参数、抗氧化酶、渗透调节物质等21项生理生化指标,并以各指标的抗旱系数为抗旱性评价指标,在主成分分析的基础上,利用加权隶属函数法对供试油菜品种的抗旱性进行综合评价,然后对各指标在抗旱性评价中的作用进行了比较分析.频次分析表明,三种油菜的光合参数指标(Pn,Gs,Tr,C
为探究避雨栽培与露地栽培蓝莓果实贮藏品质差异,采用避雨和露地两种栽培方式种植\'蓝丰\'、\'北陆\'蓝莓,采后用PET盒分装后放入聚乙烯(PE)袋中,0℃下预冷24h后扎口冷藏,对比分析冷藏期间两种栽培方式蓝莓果实品质变化.结果 表明,避雨栽培蓝莓果实可溶性固形物含量、可溶性糖含量显著高于露地栽培,可滴定酸含量、果实含水量和花色苷含量显著低于露地栽培,在采后0℃贮藏期间,避雨栽培果实相较露地栽培更能有效地抑制好果率的下降和果实质量损失率的升高,延缓果实水分含量、可滴定酸、可溶性固形物、总
为了培育高产优质的油茶品种和提高本地海南油茶的产量及经济效益,本研究对海南省不同产区的油茶优树进行了详细的调查研究,仔细筛选出了30株油茶优树并对其进行系统分析.对其所选油茶优树果实经济性状指标、生物学特性、脂肪酸组成及含量、主要脂肪酸相关性和茶油品质等方面作了具体分析.结果 表明,果实经济性状的指标均存在极显著差异(P<0.01);其主要生物学特性表现优异的油茶优树,其茶油品质较好,反之,则品质较差;其脂肪酸组成及含量也呈现不同差异,亚油酸含量变异程度较大,而油酸含量则相对稳定;主要脂肪酸的相关性表现为
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自20世纪80年代以来,上海地区先后多次从大连、烟台等地引进甜樱桃,但时常出现“花而不实”、畸形果率偏高等问题.目前,通过筛选低需冷量的品种、应用物理或化学调控措施,甜樱桃已在上海、浙江等长三角地区实现了连续的小面积丰产.本研究以上海交通大学浦江绿谷实践基地的甜樱桃品种为研究对象,对不同砧穗组合、不同整形方式、是否经过单氰胺处理的甜樱桃品种的生物学特性进行评价.通过调查树高、干径、新梢长度和粗度、物候期、芽密度、花密度、花器官发育、坐果率以及果实品质等指标,综合评价不同品种的甜樱桃在上海地区的表现,以期为
为了明确粳糯谷子waxy基因DNA全序列及其氨基酸序列多态性,以3份糯质和2份非糯谷子品种为材料,通过Primer Premier 5.0引物设计、PCR扩增、目的 片段纯化、阳性克隆和菌液PCR测序拼接,以Setaria italica v2.2 (Foxtail millet)基因为参考序列,分析参试材料间waxy基因全序列的多态性位点,利用在线SMART (http://smart.embl-heidelberg.de/)分析预测其waxy氨基酸序列及其二级结构域.结果 表明,(1)waxy基因全序
小米直链淀粉与支链淀粉的含量是影响蒸煮和食味品质的重要性状.粳谷和糯谷在籽粒灌浆期淀粉合成的途径和成分不同.利用高通量测序技术IlluminaHiseq4000对糯谷\'公谷68\'和粳谷\'赤谷4号\'(灌浆期第1天和第5天)未成熟籽粒进行转录组测序.结果表明:(1)糯谷和粳谷GBSSⅠ酶活性均呈低-高-低的趋势,二者活性大小存在一定差异.糯性品种\'公谷68\'灌浆期第5天与第1天筛选出665个上调差异表达基因,上调基因较下调基因多431个;粳性品种\'赤谷4号\'灌浆
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